La microbiota, popularment coneguda com flora microbiana, és el conjunt de microorganismes que habiten en diferents parts del cos humà, principalment en el tracte intestinal.
El microbioma és el conjunt format per la microbiota i el seu ecosistema, incloent el genoma microbià, gens mòbils (fagos i plasmidis), metabòlits, condicions ambientals i la interrelació amb l’hoste a través de les seves barreres (mucoses i pell). Aquesta unitat funcional té un paper crucial en el manteniment de la salut i l’equilibri de l’organisme.
Cumpleix múltiples funcions essencials, com la digestió dels aliments, la producció de vitamines, l’equilibri metabòlic, la protecció contra patògens i la regulació del sistema immunològic. Tanmateix, quan el microbioma està alterat, pot donar lloc a diverses malalties.